Ces procédés, réservés à des cas très particuliers, éliminent une partie plus ou moins importante de l'intestin, de l'estomac ou des deux en même temps.

On pourrait associer à cette catégorie la diversion duodénale qui consiste à dériver les sécrétions biliaires et pancréatiques, et qui aujourd'hui a des indications chirurgicales différentes de l'obésité morbide.

Ces procédés entraînent tous à court ou moyen terme des troubles de l'absorption, des carences alimentaires et vitaminiques, sources de complications graves, voire majeures, incompatibles avec une vie normale.